История МБОУ «Советская ООШ» неразрывно связана с историей поселка.
В разное время школа носила разные названия: «Изонинская», «школа Пятовского УЖД» (узкоколейная железная дорога), «Советская», находим эти названия в газетах с 1953 года.
На основании решения исполнительного комитета Вологодского областного Совета депутатов трудящихся от 09 октября 1953 года № 1263 Тотемскому райисполкому разрешено открыть в поселке Изониха Изонинскую начальную школу.
Школу разместили в здании общежития, выделив одну комнату. Учебный год начался 4 сентября 1953 года. В классном помещении было 9 парт, чёрная доска и глобус. На начало учебного года в 3-х классах обучалось 17 человек.
Ширится поселок, растет количество жителей и учеников в поселке, улучшаются жилищные условия. С февраля 1954 года упоминается название поселка – Советский на р.Сухона. Изонинская начальная школа переименована в Советскую начальную школу на основании решения исполнительного комитета Тотемского районного Совета депутатов трудящихся Вологодской области от 27 апреля 1955 года.
На основании решения исполнительного комитета Тотемского районного Совета депутатов трудящихся от 30 мая 1957 Советская начальная школа реорганизована в Советскую семилетнюю школу. С 1 сентября 1957-1958 учебного года в школе открыт 5 класс. Пятьдесят мальчиков и девочек впервые пришли в Советскую семилетнюю школу. Идет тесное сотрудничество школы с колхозом «Организатор» и Пятовским лесопунктом. Колхоз и лесопункт берут на себя обязательства «отремонтировать здание Советской семилетней школы, …. достроить выносные мастерские». В 1959 году создана первая пионерская организация в школе.
Советская семилетняя школа реорганизована в восьмилетнюю школу на основании Постановления исполнительного комитета Вологодской области Совета депутатов трудящихся и областного комитета КПСС от 10 февраля 1961 года.
С 1 сентября 1961 года Советская семилетняя школа реорганизована в восьмилетнюю школу. Советская восьмилетняя школа быстро растет, ежегодно прибывает по 70-80 учащихся. Школа расположена в пяти неприспособленных зданиях, помещений не хватает.
В 1962 году закладывается стадион. Школьники впервые участвуют в районных соревнованиях по футболу. Начался сбор материалов об участниках Великой Отечественной войны, был оборудован класс «Боевой славы». Первым экспонатом музея стал металлический бюст Владимира Ильича Ленина, привезённый из Вологды в честь недельной экскурсии по городу. В 1966 году был создан класс «космонавтики».
Решением исполнительного комитета Вологодского областного Совета депутатов трудящихся от 24 мая 1973года Советская восьмилетняя школа реорганизована в среднюю школу». В 1974г. закладывается новое типовое здание школы на 450 мест. В уборке строительного мусора, внутреннего и внешнего благоустройства школы, пришкольного участка принимали участие все: директор школы, учителя, ученики и их родители».
1 сентября 1976г. начались занятия в новостройке. Полмиллиона рублей затрачено на строительство школы, более тысячи рублей на каждого ученика. Юрий Пантелеймонович создал фонд школы, который использовался для экскурсий по городам Союза Советских Социалистических Республик». В 1974 году поездки – в Белоруссию, в 1982 году – г. Краснодон, в 1983 году –Хатынь, в 1985 году- г. Волгоград.
В 1979 была организована совместная деятельность школьного лесничества с Тотемским лесхозом. Был составлена необходимая документация. Учащиеся за работу отмечены Грамотой и вымпелом «Лучшему школьному лесничеству» за природо-охранную работу, Почетной грамотой за хорошую работу по выращиванию и охране лесов и Дипломом 3 степени - школу, занявшую среди школ района в природоохранной, опытнической работе».
Статус муниципального образовательного учреждения Учреждение получило на основании Постановления администрации Тотемского района от 11.07.1995года № 345.
12 июня 2003 года школа отметила 50-летний юбилей, в честь этого события был торжественно открыт музей. С 2003 года организуются ежегодные субботники по уборке территории школы и центральных улиц поселка. Благоустроен карьер, очищен от мусора и свалок.
В 2004г. в связи с закрытием коррекционной школы в г. Тотьма обучающиеся были переведены в Советскую школу. Открыты специальные (коррекционные) классы 8 вида и подготовлен пришкольный интернат. Главным направлением работы в этот период становится – экологическое обучение и воспитание. С 2006 года 11- классники принимают участие в ежегодном районном Бале выпускников на центральной площади в г. Тотьма. Создается школьный флаг с эмблемой.
В 2008 году школа отметила 55 – летний юбилей. Последний (57) выпуск средней школы будет 26 июня 2010 года. Десятиклассники поедут учиться в город получать среднее образование. На основании распоряжения Управления образования Тотемского муниципального района - Советская средняя школа с 01.09.2010 г. становится основной школой.
В связи с внесением изменений в Устав в августе 2011 года, приказ Управления образования Тотемского муниципального района от 02 августа 2011 года № 255, изменилось название школы «Муниципальное бюджетное образовательное учреждение «Советская основная общеобразовательная школа» (сокращенное наименование МБОУ «Советская ООШ»).
С 14 июля 2015 года школа является Муниципальным бюджетным общеобразовательным учреждением "Советская основная общеобразовательная школа». В школе активно работает система дополнительного образования. Созданы детские общественные организации: «ШУС» – школьное ученическое самоуправление, Волонтерский отряд «Страна добра», отряд юных инспекторов дорожного движения «Дорожный патруль», юнармейский отряд «Пламя», школьное лесничество «Лисята».
В 2020 году в школе проведён ремонт. Выполнена замена кровли, покраска здания снаружи, внутренний косметический ремонт кабинетов, пищеблока и обеденного зала. Пополняется цифровое оборудование школы.
В 2022 году проведен ремонт здания пришкольного интерната.
С 1 сентября 2022 года в рамках реализации национального проекта «Образование» в школу поступило новое оборудование и открыт Центр естественно-научной и технологической направленностей «Точка роста».
